莱加内斯队标:大鵬新區高科技農業企業發布首個亞洲家豬基因圖譜

信息來源: 更新時間:2019-10-08 15:10 【字體: 【內容糾錯】

莱加内斯球衣 www.xoucoi.com.cn   近日,由位于大鵬新區的中國農業科學院深圳農業基因組研究所(以下簡稱“基因組所”)豬基因組設計育種創新團隊,于BioRxiv在線發布了中國優良地方豬——陸川豬的高質量基因組序列。該基因組序列的發表,不僅填補了亞洲家豬缺少高質量參考基因組的空白,更為基因組組裝提供了新的方向。

  我國地方豬群具有豐富的遺傳多樣性,是深入挖掘豬種肉質品質和抗病力等重要性狀優質基因的遺傳寶庫。然而,隨著西方商業豬種的普及,本地豬種受到了非常大的沖擊,有些著名地方品種的數量比大熊貓還要稀少,部分品種甚至已經滅絕,地方豬種質資源的?;た灘蝗莼?。

  經過不懈的努力與技術攻關,研究團隊最終獲得了染色體級別的豬基因組序列,contig N50超過了18Mb,Scaffold N50 超過了140Mb。并且利用最新的組裝算法和Hi-C技術,獲得了完整的兩套基因組序列。這是基因組研究領域的重大突破,為研究等位基因的功能互作提供了寶貴的數據和技術基礎。

  “我們本次組裝得到的豬基因組,除了有很高的連續性外,更是成功地獲得了2套染色體級別的基因組序列,這在基因組組裝研究領域尚屬首次?!畢钅扛涸鶉頌浦辛盅芯吭斃朔艿廝?,這意味著可以同時研究同源染色體的變異,以及來自不同親本的等位基因功能。